便秘从病因上可分为器质性和功能性两类。
1.器质性病因
主要包括：
(1)肠管器质性病变：肿瘤、炎症或其他原因引起的肠腔狭窄或梗阻。
(2)直肠、肛门病变：直肠内脱垂、痔疮、直肠前膨出、耻骨直肠肌肥厚、耻直分离、盆底病等。
(3)内分泌或代谢性疾病：糖尿病、甲状腺功能低下、甲状旁腺疾病等。
(4)系统性疾病：硬皮病、红斑狼疮等。
(5)神经系统疾病：中枢性脑部疾患、脑卒中、多发硬化、脊髓损伤以及周围神经病变等。
(6)肠管平滑肌或神经源性病变。
(7)结肠神经肌肉病变：假性肠梗阻、先天性巨结肠、巨直肠等。
(8)神经心理障碍。
如果便秘无上述等明确病因，称为功能性便秘(chronic functional constipation，CFC)。在有便秘史的人群中，功能性便秘约占50%。
2.功能性病因
功能性便秘病因尚不明确，其发生与多种因素有关，包括：
(1)进食量少或食物缺乏纤维素或水分不足，对结肠运动的刺激减少。
(2)因工作紧张、生活节奏过快、工作性质和时间变化、精神因素等干扰了正常的排便习惯。
(3)结肠运动功能紊乱所致，常见于肠易激综合征，系由结肠及乙状结肠痉挛引起，除便秘外同时具有腹痛或腹胀，部分病人可表现为便秘与腹泻交替。
(4)腹肌及盆腔肌张力不足，排便推动力不足，难于将粪便排出体外。
(5)滥用泻药，形成药物依赖，造成便秘。
(6)老年体弱、活动过少、肠痉挛导致排便困难，或由于结肠冗长所致。
